Els rius de Madagascar tenen un flux ràpid. Tots els rius principals de l'illa flueixen d'est a oest.
Riu Betsibuka
El llit del riu es troba a les terres del nord-oest de l’illa. La longitud total del corrent és de 525 quilòmetres. I aquest és un dels rius illencs més grans. Betsibuka es caracteritza pel color marró vermellós de la seva aigua. L’explicació d’aquest fenomen és molt senzilla: les aigües del riu contenen un gran volum de sediments que el riu transporta al mar.
La font del riu es troba al centre de l'illa (al nord de la província d'Antananarivo). El riu neix a la confluència de dos rius: Amparihibe i Dzabu. Després d’això, Betsibuka parteix cap al nord, cap a les aigües del riu Ikupa (prop de la ciutat de Maevatanana). El Betsibuca desemboca a les aigües de la badia de Bumbetuca (estret de Moçambic), formant un delta quan cau. El llit del riu és navegable a 130 quilòmetres del lloc de confluència.
El to marró vermellós de l’aigua del riu és un signe d’un desastre ecològic. La desforestació de la superfície de l'illa ha accelerat el procés d'erosió del sòl. Com a resultat, la quantitat total de terra rentada per l'aigua és increïblement enorme. I ja que es tracta de sòls laterítics majoritàriament vermells, d’aquí l’ombra de l’aigua.
Els sediments transportats pel riu a les seves aigües s’estableixen al fons de l’estuari de Betsibuk. I aquest és un dels motius de l’envasament del fons de la badia de Bumbetuka. És per aquest motiu que el port de la ciutat de Mahajanga, situat aquí, es va traslladar a la costa exterior de l'illa, ja que existia l'amenaça d'aterrar vaixells oceànics.
Riu Mangoki
El riu travessa les terres del sud-oest de l'illa. La longitud total del corrent Mangoki és de 564 quilòmetres. I és el riu més llarg de Madagascar.
La font es troba a la província de Fianarantsoa (vessants de la cresta central). Després, el riu flueix cap a l'oest, passant per les terres de la província de Tuliara. El lloc de confluència són les aigües de l’estret de Moçambic (prop de la ciutat de Morombe). Quan hi desemboca, forma un gran delta.
El canal Mangoki discorre per terrenys difícils. La part sud del delta és rica en illes barreres, bancs i espits al·luvials. La part nord del delta ofereix nombrosos pantans i manglars.
Riu Maninguri
El riu Maninguri es troba a la part oriental de Madagascar i té una longitud total de 260 quilòmetres. La font del riu es troba al llac Alautra. La superfície total de la conca és de 12.645 quilòmetres quadrats. El riu es caracteritza per un corrent turbulent. El lloc de confluència són les aigües de l’oceà Índic (prop de la ciutat d’Ampasina).