En la seva major part, els rius del Perú pertanyen a la conca del riu més gran del món: l’Amazònia.
Riu Javari
Zhavari és un dels rius situats a la part central de Sud-amèrica. Geogràficament, el llit del riu pertany a dos països: el Perú i el Brasil. La longitud total del canal és de 1.056 quilòmetres. El Javari passa per la part nord-oest del Brasil i és un afluent dret de l'Amazones.
La font del riu es troba als vessants dels Andes peruans (La Montagna). Després descendeix de les muntanyes i la resta del corrent és la frontera natural entre Brasil i Perú.
El riu es pot navegar durant 500 quilòmetres des de la desembocadura. Durant la temporada de pluges, que dura de gener a maig, la longitud del tram navegable augmenta.
Riu Girua
Girouis és un dels molts afluents de l'Amazones. La longitud total del riu és de 3280 quilòmetres. La font és la ciutat de La Montia (Perú), situada als contraforts dels Andes peruans.
El riu és navegable durant 1.823 quilòmetres des de la seva confluència (fins al territori del municipi de Cruzeiro do Sul). La conca del riu està habitada, però principalment al curs mitjà del riu.
Riu Kurarai
Curarai és un dels rius sud-americans situats al territori de dos països: l’Equador i el Perú. És l’afluent dret del riu Napo. El naixement del riu són els contraforts orientals dels Andes.
La longitud total del canal és de 800 quilòmetres. I passa pel territori de Pastes (província de l’Equador) i Loreto (regió del Perú). El territori del Perú té una longitud de 414 quilòmetres. Kurarai és profund durant tot l'any, però només es pot navegar per la part baixa. El llit del riu passa per zones poc poblades. Principalment els pobles indis - Waorani i quítxua - viuen a la vora del riu.
Riu Madre de Dios
Madre de Dios passa pel territori de dos països –Perú i Bolívia– i pertany a la conca amazònica. La longitud total del llit del riu és de 640 quilòmetres.
La font del riu es troba als Andes peruans.
Madre de Dios és una de les vies fluvials més importants situades a la part alta de l’Amazònia. A la vora del riu hi ha una gran ciutat portuària: Puerto Maldonado. Després d’ell, el riu és navegable.
La vall del riu s’utilitza activament per al cultiu de mangos. A més, aquí s’extreu or, així com l’explotació forestal a escala industrial. Hi ha diversos espais naturals protegits a la vora del riu.
Riu Mantaro
El llit del riu es troba íntegrament al Perú i té una longitud de 724 quilòmetres. El Mantaro és una branca del riu Apurimaca. Geogràficament passa per les terres de les províncies següents: Junin; Yauli; Hauka; Concepció; Huancayo.
